Увеличение производства биоэтанола вызывает появление и рост морских пустынь. Тому примером может послужить безжизненная пустыня в Мексиканском заливе площадью со штат Нью-Джерси. Всему виной река Миссисипи, несущая в своих водах огромное количество биогенных веществ и удобрений.

Проблема развивается следующим образом. Мировой топливный кризис стал причиной расширения и интенсивного использования сельскохозяйственных земель для выращивания зерновых, которые идут полностью на производство этилового спирта. Такое интенсивное использование земель сопряжено с внесением огромного количества удобрений, которые с подземными и дождевыми водами попадают в реки. Реки выносят удобрения в моря и океаны. Биогенные вещества удобрений вызывают бурный рост и развитие поверхностных водорослей, которые становятся непреодолимым барьером на пути проникновения кислорода и солнечных лучей в морскую толщу. Для придонных водорослей света оказывается света недостаточно, и они погибают. В толще воды начинается ощущаться нехватка кислорода, что вызывает тотальную гибель всех водных обитателей.
В будущем Мексиканский залив ждёт не завидная судьба. В конце 2007 года Джордж Буш, с целью снижения нефтяной зависимости США, подписал закон об увеличении в 3 раза производства этилового спирта из зерна.